Была проведена проверка передачи строки с данными, "Энтер" передается в конце. Пробовали менять и удалять суффикс, результат то же.

У данного сканера, настроек по передаче строки с данными, нет. Существует ручной ввод штрих кода, при ручном вводе все передается как нужно.
Вы можете протестировать программу в связке с этим сканером (Mindeo MS3390) и сообщить о результате?

При подключении сканера к смартфону как "Bluetooth - клавиатура", все работает отлично, думаю проблема все же не в передаче строк.