Спасибо большое, ваши пункты помогли придти к истине - так как настраиваю удаленно, не смог сам этот момент проконтролировать, оказывается сканер последнюю цифру не выводит. И дело не в приложении, вне его он также её не вводит. Клиент сказал, что будет привлекать специалиста на месте.

Забудьте всё, что сверху. Всё сделал, всё настроил. Подключал Склад 15 на новом компьютере к другой БД, всё так же через RDP. Выгрузил номенклатуру, но когда на ТСД создаешь документ "Инвентаризация" и пытаешься отсканировать товар, то ТСД товар не узнает, предлагает добавить как неизвестный. Порылся в папке обмена, нашел там файл productsIndex.txt, в котором видимо отражается информация о номенклатуре, потом нашел этот файл на ТСД, и там штрихкоды присутствуют. Почему он не может соотнести ШК с номенклатурой - я не знаю